Yu Zhang
@yuzhang
生物信息工程师，擅长深度学习与多组学建模，交付高准确率预测与云端AutoML产品。
ChinaWhat I'm looking for
我是一名生物信息工程师，专注把深度学习方法落到复杂业务与科研问题上，尤其擅长从异构序列与多组学数据中提炼可解释、可验证的预测能力。
在实习期间，我围绕“基于深度学习的蛋白质相互作用预测”提出“双流特征融合”结构，将TCR序列与新抗原编码嵌入统一空间；通过通道注意力CNN优化空间特征筛选，在小样本（<500）场景下AUC提升19%，独立验证集预测准确率达85.80%。我负责从数据清洗、特征工程、模型实现到可视化展示的全流程开发。
在工作中，我主导蛋白-代谢-转录多组学跨维度整合项目，使用PCA/CCA等多变量统计模型完成数据降维与疾病分型建模，并实现关键生物标志物筛选准确率提升20%；同时基于差异代谢物与临床指标构建疾病早期诊断模型，AUC达到0.95，并优于客户基线模型16%。我还设计纵向时间序列分析框架，识别出3个关键预后因子。
我同样重视工程化与产品化：负责云端AutoML工具链搭建，封装并集成LR/SVM/RF等10+算法，实现模型自动训练与评估，支持可视化参数调优与零代码建模流程，并通过单元测试与流程验证保障交付质量。
Experience
Work history, roles, and key accomplishments
生物信息工程师
上海中科新生命生物科技有限公司
Nov 2023 - Present (2 years 6 months)
主导蛋白-代谢-转录多组学跨维度数据整合与疾病分型建模，关键生物标志物筛选准确率提升20%；基于差异代谢物与临床指标构建疾病早期诊断模型，AUC达0.95，较客户基线模型提升16%。同时设计纵向时间序列分析框架识别3个关键预后因子，并搭建云端AutoML工具链，封装10+算法支持可视化参数调优与零代码建模流程。
生物信息学实习生
上海市生物医药技术研究院
Jul 2021 - Jun 2023 (1 year 11 months)
围绕深度学习蛋白质相互作用预测开发“双流特征融合”结构，并用通道注意力CNN优化空间特征筛选；在小样本（<500）场景下AUC提升19%，独立验证集准确率达85.80%。负责从数据清洗、特征工程、模型实现到可视化展示的全流程开发（Python + PyTorch + Flask）。
Education
Degrees, certifications, and relevant coursework
上海理工大学
Master of Science, Electronic Information
2020 - 2023
Completed a master’s program in Electronic Information at Shanghai University of Science and Technology from 2020 to 2023.
江西科技师范大学
Bachelor of Engineering, Computer Science and Technology
2016 - 2020
Completed a bachelor’s program in Computer Science and Technology at Jiangxi Science & Technology Normal University from 2016 to 2020.
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